Журнал учрежден Фондом развития конфликтологии и Международной ассоциацией конфликтологов в 2005 г. С момента учреждения издано 20 номеров.
С февраля 2010 г. журнал "Конфликтология" включён в перечень научных журналов ВАК, в которых могут быть опубликованы результаты исследований по кандидатским и докторским диссертациям.